因應本會要求跨領域大樓變更設計狀況（四次設計圖）

2009年2月潘冀建築師事務所原設計圖。（潘冀建築師事務所競標時提出）
1. 實驗室靠社區
2. 離39-45號七樓大樓35公尺
3. 離七十巷院界14公尺

2009年3月27日中研院因應本社區要求指示潘冀建築師事務所提出修正設計。（於第一次籌建委員會會議提出）
1. 部分實驗室仍然靠近社區
2. 離39-45號七樓大樓41公尺
3. 離70巷院界20公尺及15公尺


2009年4月16日根據第一次籌建委員會建議，潘冀建築師事務所再提出修正設計圖。（於第二次籌建委員會會議提出）
1. 行政及研究室鄰近社區
2. 離39-45號七樓大樓51公尺
3. 離70巷院界30公尺及20公尺


2009年8月依台北市土地使用管制規則規定，將建築物往左移約2公尺；建築物北側自地界退縮20公尺原則不變。